Traženje proteinskih motiva (eng. protein motif scanning) je vrlo rasprostranjena tehnika u bioinformatici. Koristi se za predviđanje strukture ili funkcije proteina, te za klasifikaciju novootkrivenih nizova u proteinske familije. U svojoj iterativnoj verziji, traženje motiva uključuje elemente strojnog učenja i optimizacije.
Na predavanju ćemo prikazati neke standardne i nove metode za iterativno traženje proteinskih motiva, te pokazati vezu točnosti pretrage sa strukturom pripadnog težinskog grafa.